Alexander Koch

Dr. Alexander Koch

Postdoc, Experimental Cancer Pathology Group

Aandachtsgebieden

Alexander focust zich op het onderzoek naar DNA methylatie biomerkers voor de detectie van colorectale kanker. Hij houdt zich hoofdzakelijk bezig met het integreren, analyseren en visualiseren van de experimentele data. Dit onderzoek wordt uitgevoerd binnen het MEDOCC (Molecular Early Detection Of Colorectal Caner) project, een internationale samenwerking tussen het KWF Kankerbestrijding (Nederland), Stand Up To Cancer en de American Association for Cancer Research (allebei VS).
Alexander werkt ook mee aan een pilot project in samenwerking de research IT afdeling van het MUMC rond de oprichting van een gecentraliseerde database voor onderzoeks- en patiëntengegevens.

Contact

email: a.koch@maastrichtuniversity.nl

+31 43 388 42 87

Curriculum Vitae

Alexander (1986, Gent, België) studeerde bio-ingenieurswetenschappen aan de Universiteit Gent in België

Alexander Koch is gepromoveerd aan de Universiteit Gent in 2014 op het proefschrift: "Different approaches to measuring gene expression and DNA methylation and their application in cancer research" onder supervisie van prof. Wim Van Criekinge, prof. Tim De Meyer en dr. Gerben Menschaert.

Tijdens zijn opleiding heeft Alexander zes maanden bij prof. Stephen Baylin (Johns Hopkins School of Medicine, Baltimore, VS) gewerkt op epigenetische alteraties in long kanker. Hij heeft ook twee maanden in het lab van prof. David Fenyö (New York University, New York, VS) doorgebracht waar hij onderzoek rond proteogenomics heeft verricht.

Publicaties:

A Koch, T De Meyer, J Jeschke and W Van Criekinge.MEXPRESS: visualizing expression, DNA methylation and clinical TCGA data. BMC GENOMICS 16 (2015)

J Crappé, E Ndah, A Koch, S Steyaert, D Gawron et al. PROTEOFORMER: deep proteome coverage through ribosome profiling and MS integration. NUCLEIC ACIDS RESEARCH 43 (2015)

A Koch*, D Gawron*, S Steyaert, E Ndah, J Crappé et al. A proteogenomics approach integrating proteomics and ribosome profiling increases the efficiency of protein identification and enables the discovery of alternative translation start sites. PROTEOMICS 14, 2688-2698 (2014)

J Wrangle*, W Wang*, A Koch*, H Easwaran, HP Mohammad et al. Alterations of immune response of non-small lung cancer with azacytidine. ONCOTARGET 4, 2067-2079 (2013)

G Menschaert, W Van Criekinge, T Notelaers, A Koch, J Crappé et al. Deep proteome coverage based on ribosome profiling aids mass spectrometry-based protein and peptide discovery and provides evidence of alternative translation products and near-cognate translation initiation events. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS 12, 1780-1790 (2013)